A striatum a substantia nigra pars compactájából kap dopaminerg rostokat, melyek a basalis ganglionok direkt körét serkentik, az indirekt kört pedig gátolják, így a motoros thalamus serkentésével a thalamocorticalis motoros körre aktiváló hatásuk van (ld. a basalis ganglionok leírását, ill. 20. ábra). Parkinson-kórban a substantia nigra dopaminerg sejtjei pusztulnak, ami miatt a direkt út működésének csökkenése és az indirekt út aktivitásának növekedése nagymértékben fokozza az STN és a Gpi aktivitását. Ez gátló hatást fejt ki a thalamocorticalis neuronokra. Így csökken a motoros kéreg aktivitása, mely hypokinesishez (a mozgásmennyiség, illetve a mozgásamplitúdó csökkenése), akinesishez (mozgáshiány), bradykinesishez (a mozgás lassulása), rigiditáshoz (izommerevség, a flexor és extensor izmok tónusa is fokozódik) vezethet. A premotoros és primer motoros kéreg inputjának csökkenése okozhatja a mozgások előkészítésének és megkezdésének zavarát. A parkinsonos tremor (remegés) magyarázata nehezebb. A thalamus VL magjában és a motoros cortexben vannak olyan neuroncsoportok, melyek kisülési frekvenciája megegyezik a nyugalmi tremoréval, így valószínűleg a thalamus sejtjei tartják fenn azt. Meg kell jegyezni, hogy nemcsak a dopamin mennyisége csökken Parkinson-kórban, hanem a noradrenaliné is a locus coeruleus károsodása miatt, valamint a szerotoniné is a raphe magok sejtjeinek pusztulása következtében.