Keserű György Miklós (szerk.)

Gyógyszerkémia


4.5.5.4. Fragmensalapú vegyületkönyvtárak

Hann és munkatársai (Hann és mtsai, 2001) már 2001-ben azt találták, hogy a vezérmolekula-felfedezés sikeressége fordított arányban van a molekulák komplexitásával. A vegyületkönyvtárak alacsony sikeraránya, idő- és költséghatékonyság, valamint elméleti megfontolások vezettek a fragmenskönyvtárak elterjedéséhez (Keserű és mtsai, 2016) és az erre épülő fragmensalapú gyógyszertervezéshez (Murray és mtsa, 2009).
A fragmensek kis molekulák, jellemzően 150–250 Da közötti molekulatömegűek és meglehetősen hidrofilek (megfelelnek a Lipinski-féle 3-as szabálynak: logP < 3, molekulatömeg < 300, max. 3 hidrogénkötés-donor, illetve -akceptor, 3 vagy kevesebb rotálható csoport), mégis kiterjedt kémiai teret képviselnek.
A fragmensek kisebb méretük miatt általában gyengébben kötődnek a célponthoz, mégis nagyon „atomhatékonyak”. Viszonylag kevés kölcsönhatásuk van a fehérjecélpontokkal, de ezek a „minőségi” (entalpiavezérelt) kölcsönhatások általában esszenciálisak a kötődés szempontjából (Ferenczy és mtsa, 2016). A fragmensek által a kémiai tér lefedettsége is sokkal nagyobb, mint egy nagyobb molekulatömegű hagyományos vegyületkönyvtár esetén (Ferenczy és mtsa, 2020).
Mivel a kötődési affinitások a 0,1–10 mM tartományban vannak, érzékeny szűrési módszerekre és nagyobb vegyületkoncentrációkra van szükség. A biofizikai módszerek (pl. differenciális pásztázó fluorimetria (DSF)) jól megfelelnek ezeknek a követelményeknek.
A témát részletesen a 4.3. fejezet tárgyalja (Makara Gergely: Kémiai kiindulópont-keresés fragmensszűréssel)

Gyógyszerkémia

Tartalomjegyzék


Kiadó: Akadémiai Kiadó

Online megjelenés éve: 2026

ISBN: 978 963 664 145 0

A kötet az Akadémiai Kiadónál 2011-ben Gyógyszerkutatás kémiája címen megjelent kézikönyv hagyományaira alapozva a kismolekulás gyógyszerkutatás eszköztárára és módszertanára fókuszál. Újdonságot jelent a magyar nyelvű szakirodalomban, hogy a modern gyógyszerkémiai felfogásnak megfelelően nem pusztán a meglévő gyógyszerkincs kémiáját mutatja be, hanem betekintést enged a kismolekulás gyógyszerek felfedezésének stratégiájába is.

Hivatkozás: https://mersz.hu/keseru-gyogyszerkemia//

BibTeXEndNoteMendeleyZotero

Kivonat
fullscreenclose
printsave