Keserű György Miklós (szerk.)

Gyógyszerkémia


4.5.5.6. Kovalens fragmens-vegyületkönyvtárak

A kovalens fragmensalapú vegyületkönyvtárak gyakran a ciszteint választják célpontként. A cisztein oldallánca szabad tiolcsoportot (–SH) tartalmaz, amely erősen nukleofil és könnyen reakcióba lép elektrofil vegyületekkel, stabil kötést biztosít. Mivel a cisztein más aminosavakhoz képest ritkábban fordul elő a fehérjék aktív helyén, viszont általában közvetlenül nem vesz részt katalitikus vagy jelátviteli folyamatokban, célzott módon támadható megfelelő elektrofil fragmensekkel. A legfontosabb elektrofil funkciós csoportok (pl. akrilamid, halogén-acetamid stb., 4.5.41. ábra) specifikusan reagálhatnak a célzott ciszteinnel.
 
4.5.41. ábra. Helyettesített akrilamid és halogén-acetamid kovalens kapcsolódása a cisztein kénatomjához
 
Resnick és munkatársai (Resnick és mtsai, 2019) létrehoztak egy 993 tagszámú akrilamid és klór-acetamid elektrofil csoportot tartalmazó kovalens fragmens-vegyületkönyvtárat, és 10 különböző, ciszteintartalmú fehérjével szemben vizsgálták azokat. A szűrést követően a gyakori, illetve promiszkuitást mutató molekulákat eltávolították. Differenciális pásztázó fluorimetria (DSF) módszerével 6 aktív kovalens fragmenset azonosítottak, ami kovalensen kötődött a NUDT7 enzimhez. Ez az enzim egy peroxiszomális CoA pirofoszfohidroláz, és számos fiziológiás folyamatban játszik szerepet, többek között a diabétesz patogenézisében is. A PCM-0102716 kovalens fragmenst egyesítették egy korábban krisztallográfiás módszerekkel azonosított nem kovalens fragmenssel (NUDT7-REV-1), és az így nyert NUDT7-COV-1 vegyület 10 µM koncentrációban 100% enzimgátlást ért el, ami duplája a nem kovalens, NUDT7-REV-1 fragmensének (IC50 = 2,7 μM) (4.5.42. ábra).
 
4.5.42. ábra. Kovalens NUDT7-enzimgátló vegyület fejlesztése fragmensegyesítés által
Forrás: saját szerkesztés
 

Gyógyszerkémia

Tartalomjegyzék


Kiadó: Akadémiai Kiadó

Online megjelenés éve: 2026

ISBN: 978 963 664 145 0

A kötet az Akadémiai Kiadónál 2011-ben Gyógyszerkutatás kémiája címen megjelent kézikönyv hagyományaira alapozva a kismolekulás gyógyszerkutatás eszköztárára és módszertanára fókuszál. Újdonságot jelent a magyar nyelvű szakirodalomban, hogy a modern gyógyszerkémiai felfogásnak megfelelően nem pusztán a meglévő gyógyszerkincs kémiáját mutatja be, hanem betekintést enged a kismolekulás gyógyszerek felfedezésének stratégiájába is.

Hivatkozás: https://mersz.hu/keseru-gyogyszerkemia//

BibTeXEndNoteMendeleyZotero

Kivonat
fullscreenclose
printsave