Keserű György Miklós (szerk.)

Gyógyszerkémia


4.7.1. Új kihívások és lehetőségek a kémiai kiindulópont-keresésben

Az elmúlt évtizedekben megnőtt a terápiás szempontból ígéretesnek tűnő, de újszerű és kevéssé tanulmányozott molekuláris célpontok száma (Zdrazil és mtsai, 2020; Xie és mtsai, 2023). Az AstraZeneca kutatói számoltak be arról, hogy 2020 óta jelentősen nőtt az olyan célpontok gyakorisága, melyek a) nem rendelkeztek ismert ligandummal, b) sem ismert fehérjeszerkezettel, c) rendezetlen fehérjedoménnel rendelkeztek, vagy d) amelyeknek molekuláris szerepe (katalitikus hatása enzim esetén) ismeretlen volt (Lanne és mtsai, 2023). Emellett különböző új terápiás modalitások megjelenése is új megközelítéseket követel meg (ld. 3. fejezet).
A kémiai kiindulópont-keresés számára a célpontok jellegének ez a trendje komoly kihívást jelent. Gyakran nemcsak a tudásalapú megközelítésekhez elégtelenek a kiindulási információk, de a részben a korábbi, jól ismert célpontcsoportok (pl. monoaminerg receptorok, kinázok) művelése során feltöltött vegyülettárak kémiai tere sem ideális az újszerű célpontokhoz.
A fenti nehézségeket részben ellensúlyozhatja, hogy a gyógyszerkémia területén szintén az elmúlt évtizedekben az alábbi, jelentős előrelépések történtek:
  • A szerves preparatív kémia, különösen a katalízismódszerek fejlődése jelentősen növelte a hatékonyan kivitelezhető reakciótípusok számát. Ez a fejlődés egyrészt nagymértékben növelte az előállított gyógyszerszerű vegyületek diverzitását, másrészt a reakciók tervezhetőségét is javította. A szintetikus reakciók gépi tanulás segítette tervezése így hatalmas méretű enumerált virtuális vegyületkönyvtárakhoz vezetett, amelyekben akár 1012 célzottan szintetizálható vegyület érhető el.
  • A kriogén elektronmikroszkópia-technológiában történt műszaki fejlődés hatására jelentősen megnőtt a rendelkezésre álló fehérjeszerkezetek száma, ami különösen a korábban szerkezeti biológiai módszerekkel nehezen megközelíthető, összetett szupramolekuláris makromolekula-rendszerek területén jelent komoly előrelépést. Emellett jelentős volt, és a fehérjeszerkezeti adatok gyors bővüléséből kifolyólag várhatóan a továbbiakban is folytatódik a gépitanulás-alapú, de novo fehérjeszerkezet-predikciók (pl. Alphafold2) fejlődése.
  • A ligandalapú virtuális szűrésben a szűrési módszerek fejlődése mellett az adatbányászati módszerek hatékonyságát jelentősen megnövelte a vegyülettárak nagy mennyiségű biológiai adatát tartalmazó adatbázisok (pl. PubChem BioAssay) megjelenése.
     
A fenti tudományos előrelépések mellett széleskörűen jelentek meg olyan újszerű technikai megoldások, amelyek a gyógyszerkutatás egyes korlátai jelentette nehézségekre kínálnak megoldást.
  • A vegyülettári oldatminták kis térfogatú és gyors kezelésében az akusztikus cseppkilövelléses módszer jelentett jelentős előrelépést. Ez a módszer nanoliter térfogattartományban is rendkívül pontos adagolással nemcsak a miniatürizált biológiai tesztek rutinszerű kivitelezését teszi megvalósíthatóvá, de hatékonyan támogatja egyedi vegyületminták gyors leválogatását, így nagy méretű célzott alkönyvtárak összeállítása a korábbinál könnyebben megvalósíthatóvá vált.
  • Új szűrési módszerek jelentek meg és terjedtek el. A DNS-kódolt könyvtárak szűrése a kémiai teret a HTS-nél hatékonyabban mintavételező, valós vizsgálaton alapuló, de jelentősen kisebb költségigényű módszer. A megfelelően nagy áteresztő képességgel kivitelezhető ASMS- és DSF-módszerek pedig a célpont működésétől függetlenül, jelölt ligandum hiányában is képesek kimutatni a kötődési jelenséget.

Gyógyszerkémia

Tartalomjegyzék


Kiadó: Akadémiai Kiadó

Online megjelenés éve: 2026

ISBN: 978 963 664 145 0

A kötet az Akadémiai Kiadónál 2011-ben Gyógyszerkutatás kémiája címen megjelent kézikönyv hagyományaira alapozva a kismolekulás gyógyszerkutatás eszköztárára és módszertanára fókuszál. Újdonságot jelent a magyar nyelvű szakirodalomban, hogy a modern gyógyszerkémiai felfogásnak megfelelően nem pusztán a meglévő gyógyszerkincs kémiáját mutatja be, hanem betekintést enged a kismolekulás gyógyszerek felfedezésének stratégiájába is.

Hivatkozás: https://mersz.hu/keseru-gyogyszerkemia//

BibTeXEndNoteMendeleyZotero

Kivonat
fullscreenclose
printsave