A lojális együttműködés kötelezettsége a tagállam minden szervére, így a bíróságokra is kiterjed.531 Ha az uniós jog szabályainak végrehajtása nemzeti intézmény, illetve tagállam feladata, a jóhiszemű együttműködés kötelezettségének megfelelően az intézmény és a tagállam köteles úgy eljárni és együttműködni, hogy az EUSz 4. cikk (3) bekezdése szerinti szabályok hatékonyan alkalmazhatóak legyenek. E kötelezettség a tagállam valamennyi szervére igaz, így a jogvédelemben betöltött különös súlyuk miatt nyilvánvalóan a tagállami bíróságokra is. A lojális együttműködés kötelezettsége megköveteli a tagállami bíróságoktól az uniós jog figyelembevételét. Ez még olyan esetekben is igaz, amikor a felek részéről közvetlenül nem történik hivatkozás az uniós jogra. A jóhiszemű együttműködés kötelezettségének elve megköveteli, hogy akár ex officio532 is felismerésre és alkalmazásra kerüljenek a tagállami bírói fórumok által az uniós jog rendelkezései. Még kifejezett jogszabályi rendelkezés hiánya sem akadályozza az uniós jogrend tartalmának és általános elveinek alkalmazását, különösen a tagállami bíróságok és az Európai Bíróság közötti igazságügyi együttműködésre vonatkozóakat. A lojális együttműködés elvének felel meg az előzetes döntéshozatali eljárás533 kezdeményezésének lehetősége az uniós jog értelmezése vagy érvényessége kérdése esetén, azon bíróságok tekintetében, melyek határozataival szemben nincs a nemzeti jog szerint jogorvoslati lehetőség, az előterjesztés kötelezettsége. Ennek kimondása azért fontos, mert az uniós jog szükségszerű egységes alkalmazása akkor is megköveteli az előzetes döntéshozatali előterjesztés tételét, ha a felsőbb fokú tagállami bíróság ítélkezési gyakorlata szemben áll az uniós bíróságokéval.