Az Áht. 8/A. §-a alapján az Országgyűlés vagy a Kormány által alapított költségvetési szerv alapításáról jogszabályban, más alapító által alapított költségvetési szerv esetén alapító okiratban kell rendelkezni. A jogszabállyal alapított költségvetési szerv esetén – a jogszabályban megjelölt alapítási időpontot megelőzően – a költségvetési szerv részére az alapításáról alapító okiratot kell kiadni. Az alapító okiratot és annak módosítását az alapító szervnek – az Országgyűlés vagy a Kormány által alapított költségvetési szerv alapító okiratát és annak módosítását az irányító szervnek, minisztériumnak, a Miniszterelnöki Kormányirodának és a kormányhivatal alapító okiratát és annak módosítását a miniszterelnöknek – kell kiadnia. Az alapító okirat kiadására jogosult személy e tevékenységében nem helyettesíthető. A Kormány irányítása vagy felügyelete alá tartozó, a miniszter által alapított költségvetési szerv – a miniszterelnök által kiadott alapító okirattal rendelkező költségvetési szerv és a honvédelemért felelős miniszter által alapított költségvetési szerv kivételével – alapító- és megszüntető okiratának kiadásához minden esetben, az alapító okirat módosításához a Kormány rendeletében meghatározott esetekben szükséges az államháztartásért felelős miniszter előzetes egyetértése. Az Áht. az alapító- és megszüntető okiratok esetében a korábbi szigorú eljárási rendet oldotta azzal, hogy nem minden esetben kell az államháztartásért felelős miniszter egyetértését megkérni, hanem ezeket az eseteket az Ávr.-ben kell meghatározni. Az Ávr. ezzel kapcsolatban azt fogalmazta meg, hogy a költségvetési szerv alapító okiratának módosításához akkor kell megkérni az államháztartásért felelős miniszter egyetértését, ha a költségvetési szerv alapító okiratának módosítására azért kerül sor, mert változik az irányító vagy felügyeleti szerv, új telephelyet létesítenek, vagy a feladatellátási hely létesítésével vagy megszüntetésével kapcsolatos a változtatás. Szintén meg kell kérni az államháztartásért felelős miniszter egyetértését, ha a költségvetési szerv közfeladata, alaptevékenysége megváltozik (ideértve ezek kormányzati funkciók szerinti megjelölésének és fő tevékenységének államháztartási szakágazati besorolásának változását is).