A dipeptidek közül a karnozin (β-alanil-hisztidin) valószínűleg neurotranszmitter szerepet tölt be, míg az aszpartám (aszpartil-fenilalanin-metilészter, Asp-Phe-OMe) fontos édesítőszer. A tripeptidek közül megemlítjük a TRH-t, a pajzsmirigyserkentő hormon felszabadulását elősegítő, a hipotalamuszban termelődő „releasing” hormont. Szerkezeti érdekessége a piroglutaminsav N-terminális (a piroglutaminsav azt jelenti, hogy az N-terminálisan elhelyezkedő Glu aminocsoportja a γ-karboxilcsoporttal gyűrűvé kondenzál). A formil-metionil-leucil-fenilalanin tripeptid érdekessége a formilált N-terminális, neutrofil sejtekre kemotaktikus hatása van.

A peptidhormonok közül említésre méltók a gonadotróp hatású hormonok, amelyeket a hipofízis elülső lebenye termel. A follikulus stimuláló hormon (FSH) a petefészek és a here szteroid-termelését indítja be, a luteinizáló hormon (LH) pedig a sárgatestben a progeszteron szintézisét, a Leydig-sejtekben a tesztoszteron szintézisét idézi elő. Mindkét hormon 25 kDa molekulatömegű. A humán choriogonadotropin (hCG) a placentában keletkezik, a terhességi tesztek ennek kimutatásán alapulnak. A prolaktin az emlők tejtermelését váltja ki. Az ACTH kapcsán már említettük a melanocita stimuláló hormont (MSH). Ezek a hormonok az ún. pro-opiomelanokortin (POMC) családba tartoznak, melyeknek közös, 208 aminosavból álló prekurzora van. Ennek különböző hasadási termékei különböző hatású hormonok. Az ACTH-n és MSH-n kívül fontosak a β-lipotropin, amely a zsírszövetekből zsírsavakat szabadít fel, valamint a belőle keletkező endorfinok, amelyek a fájdalomérzékelő receptorokhoz kötődve a fájdalomérzést csökkentik. Ugyanazon idegi receptorokhoz kötődnek, mint a morfin. A szomatosztatin a pankreászban termelődik, a növekedési hormonnal ellentétes hatást fejt ki, 14 aminosavból áll. Egyes mesterséges analógjai (ezekben egyes aminosavakat tervszerűen módosítottak) gátolják a rákos sejtek burjánzását. Az angiotenzinek vérnyomásfokozó peptidek, a bradikinin nonapeptid viszont csökkenti a vérnyomást. A 32 aminosavból álló kalcitonint a pajzsmirigy termeli, fokozza a csontok kalcium-felvételét, a mellékpajzsmirigy által termelt 34 aminosavból álló parathormon viszont ellentétesen hat a kalcitoninnal, mobilizálja a kalciumot a csontokból. A szekretin csökkenti a gyomornedv és növeli a hasnyál elválasztását, 27 aminosavból áll.

Egyes baktériumokban, gombákban sajátos szerkezetű polipeptid antibiotikumok termelődnek. Aminosav-sorrendjüket nem nukleinsavak kódolják, szintézisükben enzimek vesznek részt. Sokszor Δ-aminosavak is előfordulnak bennük és gyakori a teljesen vagy részben ciklusos felépítés. Ilyen a bacitracin A (részlegesen ciklusos, több Δ-aminosavval), a gramicidin S (teljesen ciklusos dekapeptid, több Δ-aminosavval), vagy az immunszupresszív hatású ciklosporin A (teljesen ciklusos, több Δ-aminosavval), továbbá a penicillin is. Egyes peptid-antibiotikumokban L- vagy D-hidroxikarbonsavak is találhatók, ilyenkor a peptidkötések észterkötésekkel váltakoznak. Ezeket depszipeptideknek nevezzük. Ilyen pl. a valinomicin, amely K+-ionokat képes komplexbe kötni és a membránon átszállítani, ebben a ciklusos dodekapeptidben L-valinon kívül D-valin, L-tejsav és D-hidroxi-izovaleriánsav található. A lépfene baktérium sejtfalában a természetes enzimeknek ellenálló antrax-polipeptid (poli-D-glutaminsav) található, amely ún. izopeptid-kötésekkel kapcsolódik, vagyis a glutaminsav nem az α-, hanem a γ-karboxiljaival vesz részt a peptidkötésekben.