Mandl József (szerk.)

Biokémia

Aminosavak, peptidek, szénhidrátok, lipidek, nukleotidok, nukleinsavak, vitaminok és koenzimek

4.4. Az egyszálú nukleinsavak másodlagos szerkezete

Az élővilágban a DNS legnagyobb tömege a kettős hélix konformációban van jelen, míg az RNS leggyakrabban egyszálú formában fordul elő. Vírusokban és átmeneti állapotban a DNS is lehet egyszálú formában, az RNS pedig gyakran kétszálú molekulaként fejti ki funkcióját, tehát mindkét nukleinsav lehet mindkét formában. Mint azt korábban említettük, a dupla hélix stabilitását a komplementer szálak közt fennálló kétfajta kölcsönhatás biztosítja:

Harvard

(): . : . : /hivatkozas/m1344bikaps_1019/#m1344bikaps_1019 ()

Chicago

. . . : . (: /hivatkozas/m1344bikaps_1019/#m1344bikaps_1019)

APA

(). . . (: /hivatkozas/m1344bikaps_1019/#m1344bikaps_1019)

BibTeX EndNote Mendeley Zotero

4.29. ábra. Egyszálú nukleinsav másodlagos szerkezete

Az A-T és a G-C bázispárok közti hidrogénkötések
Az egymás fölötti bázispárok közötti apoláros kölcsönhatások.

Az egy szálú polinukleotid láncok rövidebb szakaszokban létrehozhatnak a lentihez hasonló stabil, dupla szálú szerkezeteket.

Az RNS elsődlegesen egyszálú nukleinsav, primer szerkezete hasonló elvek alapján épül fel, mint a DNS, azaz a polinukleotid lánc 5’→3’ cukor-foszfát diészter kötésekkel van összekapcsolva, amelyben helyenként kialakuló bázispárosodások egyes szekvenciákat egy másik szekvenciához rögzíthetnek.

Azonos molekulában, ha egy adott bázisszekvenciát egy komplementer szekvencia követ, a lánc visszahajolhat, és egy antiparallel, kettős lánc alakulhat ki, amit „hajtű-nek” (hairpin) nevezünk. Ez a szerkezet egy dupla szálú helikális szakaszból, a törzsből, a melyet bázispárok tartanak össze, és egy egyszálú hurokból áll (4.29. ábra, 4.30. ábra).

Az egyszálú huroknak a nagysága változó lehet attól függően, hogy a komplementer bázisszekvenciák milyen távol vannak egymástól. A natív nukleinsavakban ezeknek a szerkezeteknek a vizsgálatára olyan nukleinsavbontó enzimeket (nukleáz) használnak, amelyek különbséget tesznek az egyszálú és dupla szálú nukleinsavak között. Ilyen szerkezetek előfordulhatnak a különféle RNS-fajtákban, és a DNS-ben is.