Falus András, Buzás Edit, Holub Marianna Csilla, Rajnavölgyi Éva (szerk.)

Az immunológia alapjai


14.27. Microarray módszerek

Wiener Zoltán
 
A microarray módszerek lehetővé teszik számos gén expressziójának tanulmányozását vagy adott gén(ek) polimorfizmus/mutáció vizsgálatát egyetlen kísérletben, gyorsan és hatékonyan. A módszer a hibridizáció elvén alapul. Maga az eszköz egy kicsiny szilárd hordozóra (üveglapra, nejlonmembránra, szilikonchipre) felvitt nagyszámú (akár 40 000) DNS-mintából áll, amely lehet genomikus DNS, cDNS vagy oligonucleotidok. Az egyes DNS-fragmentek jól meghatározott, megfelelő elrendezésű pontokban találhatók. A microarray által hordozott DNS hibridizáltatható mRNS-ről szintetizált, fluorokrómmal jelölt cDNS-sel vagy genomikus DNS-sel. Előbbi esetben génexpressziós profilvizsgálatról van szó, vagyis arról kapunk felvilágosítást, hogy az arrayben szereplő gének milyen mértékben fejeződnek ki a vizsgált személyben/kísérleti állatban. Az ilyen típusú vizsgálatoknak igen nagy szerepe van betegségek patomechanizmusának kutatásában. Az eredményt értékelő készülék megfelelő letapogató fej segítségével egy digitális képet készít a microarray-ről, és számítógép detektálja a fluoreszcencia lokalizációját, típusát és intenzitását. Az eredményeket speciális software segítségével értékelik. A fluoreszcens jel színe és lokalizációja mondja meg, hogy egy adott gén milyen szinten expresszálódik (a kontrollhoz viszonyítva), illetve, hogy egy adott mutáció vagy SNP jelen van-e.
Bonyolult statisztikai és bioinformatikai elemzéssel a gének mintázatának (illetve a géntermékek) közötti kölcsönhatási hálózat feltérképezésével a genetikai-genomikai szabályozásnak egy új szintje tárul fel. A mikroarray technológia a klinikumban a különböző betegségek diagnózisában, kezelésében is felhasználható lesz majd. Megfelelő kísérlettervezéssel ugyanis olyan gének „halászhatók ki” (ezek a biomarkerek), melyek expreszsziós szintje egy adott betegség pontosabb diagnózisának felállításában, vagy éppen az optimális kezelési stratégia kiválasztásában segítséget nyújthat az orvosok számára.
 

Az immunológia alapjai

Tartalomjegyzék


Kiadó: Semmelweis Kiadó

Online megjelenés éve: 2026

ISBN: 978 963 331 710 5

Hét év telt el a „Az Immunológiai alapjai” című tankönyv kiadása óta. A természettudományok számára hét év nagyon hosszú idő, különösképpen így van ez az élettudományok egyes diszciplináival, köztük az immunológiával is. A jelen kiadásban a helyenként nagyon jelentős módosulások, kiegészítések, sőt cáfolatok két forrásból fakadnak, részben a szűken vett immunológiai tudás gazdagodásából, másrészt a társtudományok (pl. a sejtbiológia, genetika-genomika, bioinformatika) immunrendszerre is vonatkozó eredményeiből. Csak pár példa, a 2007-es kiadásban alig esett szó az extracelluláris vezikulák feladatairól, ezek, az intercelluláris kommunikációs struktúrák mára a sejtbiológia tudományának egyik „forró pontjává” váltak. Akkor sokkal kevesebb hangsúlyt fordítottunk az epigenetikai módosítások jelentőségére és alig esett szó a velünk élő mikrobiális flóra szerepéről. Ma már nem csak sokkal több citokin és kemokin vált ismertté, de funkcióikat is mélyebben értjük. Emellett a CD antigének azonosítása és funkcionális jelentőségükkel kapcsolatos tudásunk is markánsan kibővült.

Hivatkozás: https://mersz.hu/falus-buzas-holub-rajnavolgyi-az-immunologia-alapjai//

BibTeXEndNoteMendeleyZotero

Kivonat
fullscreenclose
printsave